Механика Terra Nil напоминает обычный градостроительный симулятор, однако задачей игрока является рекультивация: восстановление флоры и фауны на безжизненном участке, а затем — уничтожение всех возведённых во время игры структур, так называемый обратный градостроительный симулятор.

Вы видите на экране участок земли в изометрии, напоминающей классические градостроительные симуляторы, изначально не имея ни воды, ни растительности, ни плодородной почвы. Постройте ветряки или другие источники электричества, после чего восстановите плодородие почвы и засадите достаточную площадь растениями.

Помимо этого, доступны средства изменения климата: повышения и понижения влажности и температуры, что требуется для различных строений, а достижение некоторых значений температуры и влажности.